Dr. Biswas Dr. Pradip Biswas, 物理学助理教授, 已经建立了一个计算生物物理学和生物工程小组来进行生物分子建模, 发展的修女, 经典和多尺度的分子动力学模拟, 和对接. 目的是研究蛋白质的反应机理和过渡态,以及在分子水平上理解蛋白质在聚合物表面的吸附.

目前正在进行的项目有:

  1. 通过多尺度量子力学-分子力学(QMMM)研究一氧化氮(NO)合成过程中四氢生物terin和l-精氨酸的作用. NOS系统的解耦与高血压的发生有关. 阐明这一机制将有助于了解疾病状态与正常的NOS系统. 这个项目是与李博士合作的. Valentin Gogonea来自俄亥俄州克利夫兰州立大学.
  2. 在CHARMM(哈佛分子力学化学)中开发一种多相模拟协议,用于同时对固相聚合物和液相蛋白质使用专用力场,并进行模拟,以了解吸附蛋白质的构象和功能变化. 这个项目是与李博士合作的. 南卡罗来纳州克莱姆森大学的罗伯特·拉图尔说.
  3. 研究钙结合蛋白(CaBP)在破坏雌激素-雌激素受体(ER)-CaM复合物与DNA的结合,从而防止ER- α依赖转录的作用,因为它适用于乳腺癌. 这个项目是与李博士合作的. Rajnarayanan.
  4. 建立ab-initio型经典力场,以摆脱参数的适用性(使它们拓扑独立)和极化问题.

为模拟,博士. Biswas已经建立了一个小型集群,由四个四核机架服务器和一个主服务器组成,并且正在购买另一个六核机架服务器, 夏天, 2009年秋季还会有更多, 2009. 这些服务器将被安置在信息技术部门.

目前,参与该项目的本科生共享物理实验室的空间. 一个专门的计算机集群室,用于集群的适当维护,以及配备适当计算机设施的专门的本科生工作空间,将有助于比斯瓦斯小组计划中的和正在进行的研究. 两个最近在物理研究方面受过训练的大学生已被研究生院录取.

联系信息

Pradip Biswas Ph值.D.
物理学助理教授
  
  pbiswas@cnshoescity.com